Σύμφωνα με σχέδιο Προεδρικού Διατάγματος, συστήνονται τρεις νέες γενικές γραμματείες και αντίστοιχες θέσεις γενικών γραμματέων, στα υπουργεία Οικονομικών, Εργασίας και Περιβάλλοντος. Αναλυτικότερα, στο υπουργείο Οικονομικών συστήνεται ειδική γραμματεία Δημοσιονομικών Ελέγχων, καθώς και αντίστοιχη θέση γενικού γραμματέα. Η νέα αυτή ειδική γραμματεία υπάγεται στον γενικό γραμματέα Δημοσιονομικής Πολιτικής και μεταφέρονται σε αυτή το σύνολο των αρμοδιοτήτων, οργανικών θέσεων και το προσωπικό: α) της γενικής διεύθυνσης Δημοσιονομικών Ελέγχων και β) της γενικής διεύθυνσης Ελέγχων Συγχρηματοδοτούμενων Προγραμμάτων.
Ακόμη, στο υπουργείο Εργασίας συστήνεται γενική γραμματεία Ενίσχυσης της Απασχόλησης, καθώς και αντίστοιχη θέση γενικού γραμματέα. Η νέα γενική γραμματεία θα έχει ως κύριο έργο τον συντονισμό και τη διαχείριση προγραμμάτων τα οποία χρηματοδοτούνται από πόρους του Ταμείου Ανάκαμψης και Ανθεκτικότητας (RRF). Στη νέα αυτή γενική γραμματεία του υπουργείου Εργασίας μεταφέρονται το σύνολο των αρμοδιοτήτων, οργανικών θέσεων και το προσωπικό:
1) Της διεύθυνσης Ένταξης στην Εργασία της γενικής διεύθυνσης Εργασιακών Σχέσεων, Υγείας και Ασφάλειας στην Εργασία και Ένταξης στην Εργασία,
2) Της διεύθυνσης Κοινωνικής και Αλληλέγγυας Οικονομίας,
3) Της επιτελικής δομής ΕΣΠΑ του υπουργείου Εργασίας,
4) Της επιτελικής δομής ΕΣΠΑ του υπουργείου Εργασίας, τομέα Κοινωνικής Αλληλεγγύης και
5) Της επιτελικής δομής ΕΣΠΑ του υπουργείου Εργασίας, τομέας Απασχόλησης και Κοινωνικής Οικονομίας.
Παράλληλα, η γενική γραμματεία Εργασίας του υπουργείου Εργασίας μετονομάζεται σε γενική γραμματεία Εργασιακών Σχέσεων και παραμένουν όλες οι αρμοδιότητες του τμήματος Σχεδιασμού, Παρακολούθησης και Αξιολόγησης Πολιτικών Ένταξης στην Εργασία της διεύθυνσης Ένταξης στην Εργασία, που σχετίζονται με την αντιμετώπιση της πανδημίας του κορoνoϊού.
Επίσης, στο υπουργείο Περιβάλλοντος συστήνεται γενική γραμματεία Δασών και αντίστοιχη θέση γενικού γραμματέα. Στη νέα αυτή γραμματεία μεταφέρονται, ως σύνολο αρμοδιοτήτων, οργανικών θέσεων και προσωπικό, η γενική διεύθυνση Δασών και Δασικού Περιβάλλοντος και οι υπηρεσίες που μεταφέρθηκαν στο υπουργείο Περιβάλλοντος με την από 13.8.2021 ΠΝΠ.
