Στο εδώλιο του κατηγορουμένου ο πρώην διευθυντής της Σχολής, η υπεύθυνη της Εστίας, αλλά και ο πρώην υπουργός και βουλευτής Χρήστος Μαρκογιαννάκης.
Σύμφωνα με το κατηγορητήριο, οι υπεύθυνοι της σχολής ενώ γνώριζαν ότι οι σπουδαστές ασκούσαν καθημερινά σωματική και ψυχολογική βία σε βάρος του Βαγγέλη Γιακουμάκη και ενώ γνώριζαν επίσης ότι είχαν προκαλέσει και επικίνδυνη σωματική βλάβη στον άτυχο σπουδαστή, δεν προέβησαν σε καμία ενέργεια για πειθαρχική διερεύνηση.
Η συγκεκριμένη δίκη δεν έχει να κάνει με τις αιτίες θανάτου του σπουδαστή και με τους φυσικούς αυτουργούς των βασανιστηρίων, καθώς οι ανακρίσεις για το θέμα αυτό δεν έχουν ακόμη ολοκληρωθεί.
Στη σημερινή δίκη ο πρώην διευθυντής της Σχολής και η υπεύθυνη της Εστίας αντιμετωπίζουν την κατηγορία της παράβασης καθήκοντος, ενώ ο πρώην βουλευτής δικάζεται για το πλημμέλημα της ηθικής αυτουργίας σε παράβαση καθήκοντος και ειδικότερα για τις παρεμβάσεις του που, σύμφωνα με το κατηγορητήριο, απέβλεπαν στην ευνοϊκή μεταχείριση Κρητικών φοιτητών, οι οποίοι δημιουργούσαν προβλήματα στη Σχολή.
Ο ίδιος ο κ. Μαρκογιαννάκης είχε παραδεχτεί μία μόνο τηλεφωνική του παρέμβαση για επιείκεια σε φτωχό φοιτητή, σε υπόθεση άσχετη με αυτήν του θανάτου του.
